LDH-trajectory:乳酸去氫酶軌跡分析的 R 語言研究腳手架
Table of Contents
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Introduction(引言)
乳酸去氫酶(lactate dehydrogenase, LDH)為臨床上最常使用的非特異性指標之一,於淋巴瘤、肉瘤、急性溶血等疾病具備預後意涵。然而多數研究僅以單一時間點的 LDH 數值作為自變項,忽略其時序變化所攜帶的資訊。對於慢性化療期間或多次復發的病人,LDH 軌跡可能比單次測值更具預後鑑別力。本專案以 R 語言建立軌跡分析的研究腳手架,作為後續臨床發表的基礎。
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Methods(方法)
研究框架以 R 為主,運用既有的長期資料分析套件(如 lme4、nlme、brms)建立 LDH 隨時間變化的混合效應模型。資料前處理階段以 tidyverse 嚴格清洗:移除非數值、處理檢驗單位差異、標註異常值並依臨床判斷處理。模型輸出包含個體層級的軌跡斜率、群體層級的平均趨勢,以及與臨床終點的關聯。
設計上特別強調可重現:每一次分析皆以 Quarto 文件包覆,從資料載入、清洗、模型擬合到結果視覺化皆可一鍵重跑。模型診斷亦自動化,避免遺漏殘差檢查與隨機效應分布審視。
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Results(結果)
目前管線已能在去識別化資料集上輸出 LDH 軌跡的個體與群體斜率,並與存活終點進行 Cox 模型整合。雖然完整研究結果仍待論文發表後揭露,但管線本身已可被推廣至其他長期監測之生物標記,例如 CRP、albumin、淋巴球計數。
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Discussion(討論)
本專案的價值在於將「以時序為自變項」的研究設計具體實作於 R 中,並提供可重現的腳手架。限制方面,混合效應模型對於缺失資料機制與測量誤差敏感,需要謹慎處理;不同單位的 LDH 標準化亦是跨機構研究的挑戰。未來可結合機器學習方法(如 functional data analysis、joint models)拓展軌跡分析的方法學工具箱。
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連結
- GitHub:htlin222/LDH-trajectory
- 主要語言:R
- 最後更新:2026-04-22