## 高效減少 PDF 檔案大小：使用 Ghostscript 的詳細指南

## 簡介

減少 PDF 檔案大小是一個常見的任務，可以提高文件共享的效率並節省存儲空間。本文將深入探討如何使用 ghostscript 這個強大的命令行工具來壓縮 PDF 檔案。我們將詳細解釋各個參數的作用和調整方法，並給出具體情境下的實用範例。

# Introduction

在生物資訊學的研究與實踐中，文件閱讀和分析是日常工作的核心部分。為了提升閱讀文件的效率和準確性，適當的文件高亮工具是必不可少的。本研究介紹了在 macOS 平台上使用 bioSyntax 工具在 less 中實現代碼高亮的方法，並展示了具體的安裝和配置步驟。

## 將大型 JSON 數據轉換為 SQLite：性能提升與管理簡化之探討

# Introduction

在處理大量 JSON 數據時，僅使用 JSON 文件可能會導致性能瓶頸和管理困難。SQLite 作為輕量級的嵌入式數據庫，提供了一種高效的替代方案。本研究旨在探討將大型 JSON 數據轉換為 SQLite 的優缺點，並介紹如何使用 CLI 工具和 Python 進行處理。

# 如何使用 trap 命令

Trap bae 陷阱妹 衣服穿的黑 隱眼都戴極光灰 – 〖陷阱妹〗 by 屁孩 Ryan

## Asynchronous Command Execution in Neovim Using Lua

# Introduction

Neovim is a highly customizable text editor that allows users to leverage the power of Lua for scripting and automation. This article demonstrates how to run a Lua function in Neovim, using a specific script designed to execute a command based on the current buffer’s file path. This functionality can enhance the development workflow by integrating external tools and automating repetitive tasks.

用 Marp: Markdown Presentation Ecosystem 在各種大大小小的簡報已經兩年了，每次報完總是有人會問我是用什麼軟體做簡報。想說寫一篇簡單的從入門到放棄文。

# Illumina FASTQ 格式的序列識別行元素及其描述的整理

• @<instrument>：讀取識別行的開頭，樂器 ID 或序列 ID。
• <run num>：設備上的運行號碼。
• <flowcell ID>：流動單元 ID。
• <lane>：序列化讀取的車道號碼。
• <tile>：序列化讀取的磁磚號碼。
• <x>：DNA 集群的 X 座標。
• <y>：DNA 集群的 Y 座標。
• <UMI>：如果使用了唯一分子標識符（UMI），則此欄位會被使用。
• <read>：讀取號碼（單讀取為 1，成對端為 2）。
• <filtered>：如果讀取通過過濾則為 Y，未通過則為 N。
• <control num>：控制位數為 0（無控制位開啟）或偶數。
• <index>：樣本號碼或讀取索引。

## Graphviz 的一些範例

# Dotted edges etc 虛線邊緣等等

This example uses a edge’s attribute style to draw a dotted edge. 這個例子使用邊緣的屬性 style 來繪製虛線邊緣。

## 介紹

Nussinov 演算法是計算生物學中用於預測 RNA 分子摺疊方式的一種基於動態規劃的核酸結構預測方法。RNA 分子的結構預測對於理解其功能至關重要，因為結構直接影響 RNA 如何與其他分子互動，進而影響細胞內的生化過程。

# Bioinfomatics 的工具箱

在當今數據驅動的科學研究中，各種軟件工具和庫發揮著至關重要的作用，它們不僅能夠提高數據處理的效率，還能夠深化我們對於複雜問題的理解。以下是一些廣泛應用於數據科學、生物信息學、統計計算以及機器學習領域的主要工具，每個工具都擁有其獨特的功能和應用範圍。